More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3144 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  86.71 
 
 		 301 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  72.76 
 
 		 301 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  60.91 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  59.34 
 
 		 301 aa  332  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  56.73 
 
 		 331 aa  315  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  56.77 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  56.41 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  46.13 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  46.49 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.57 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  42.52 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  43.93 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.07 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  45.67 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  45.02 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 		 316 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  46.39 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  42.47 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  42.47 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  39.46 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  39.59 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  40 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  40 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  43 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  44.63 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.37 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  40.47 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 747 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  38.11 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  37.21 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  42.21 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  42.21 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  44.35 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  44.7 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  50 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  44.55 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  44.55 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  38.46 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  38.6 
 
 		 325 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  38.1 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  40.67 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.98 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.6 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  42.15 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  43.95 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  42.15 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  37.73 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  38.74 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.46 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  38.18 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  37.67 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  33.12 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  37.73 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  42.6 
 
 		 339 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  37.73 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.25 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.18 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  39.62 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.91 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.71 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  36.43 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  41.4 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.29 
 
 		 337 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.69 
 
 		 317 aa  158  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.13 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.05 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.81 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1723  ABC transporter related  40.85 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0159508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.23 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.79 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  42.59 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  39.91 
 
 		 339 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  43.12 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.19 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>