More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2443 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3010  twin-arginine translocation pathway signal  83.19 
 
 		 334 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  74.16 
 
 		 332 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  44.14 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.12 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  41.25 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  41.23 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.24 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.44 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.02 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.53 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  35.67 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  39.26 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3599  hypothetical protein  40.4 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.46 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.31 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.31 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.06 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.58 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.06 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.31 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.14 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.12 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.42 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.83 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  37.99 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  35.88 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 326 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  35.26 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.36 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.54 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  39.07 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.46 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.22 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.54 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  36.75 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0548  hypothetical protein  33.89 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.51 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.93 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  36.89 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  35.37 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  36.88 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.87 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.6 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.75 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  36.22 
 
 		 333 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.71 
 
 		 334 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.73 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  34.77 
 
 		 324 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  36.3 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.04 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  39 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  36.51 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.68 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  35.95 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.32 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  35.12 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.63 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  36.49 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0942  hypothetical protein  39.06 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.94 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.85 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.02 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.13 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  36.03 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  37.87 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.29 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  40.75 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.17 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.5 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0533  hypothetical protein  33.66 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  36.7 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  38.54 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  36.72 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.81 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  36.72 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  33.03 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  36.96 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.95 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.45 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  34.83 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.7 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>