More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2910 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3037  transcriptional regulator, putative  71.15 
 
 		 468 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00850156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2910  regulatory protein, GntR  100 
 
 		 468 aa  950    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.779971  normal  0.0177788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2669  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1831  transcriptional regulator  43.7 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2953  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2975  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.0575809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2860  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2829  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.93 
 
 		 474 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.74 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  23.06 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.43 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.53 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.33 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 473 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  25 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 469 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  24.89 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.02 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.67 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  25.84 
 
 		 479 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  24.65 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  25.47 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.6 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  26.58 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  25.52 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  27.29 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.32 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.91 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0112  transcriptional regulator  24.15 
 
 		 484 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 502 aa  123  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 472 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 469 aa  123  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  27.43 
 
 		 504 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.41 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  23.17 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.07 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  24.4 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.45 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.16 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.69 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.43 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.15 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  26.39 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.33 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  25.8 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  26.43 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  24.57 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  24.57 
 
 		 474 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.98 
 
 		 475 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  24.57 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  24.57 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  24.57 
 
 		 474 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>