106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2026 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  88.48 
 
 
269 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  73.38 
 
 
268 aa  400  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  74.25 
 
 
270 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  74.52 
 
 
287 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  73.75 
 
 
287 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  74.13 
 
 
262 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  74.52 
 
 
267 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  73.13 
 
 
270 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  73.75 
 
 
262 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
279 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.43 
 
 
261 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.43 
 
 
261 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  36.78 
 
 
301 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  39.18 
 
 
273 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  39.38 
 
 
273 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  39.23 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  39.23 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 
267 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  39.38 
 
 
273 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  38.08 
 
 
267 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  33.72 
 
 
267 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  40.46 
 
 
268 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  38.85 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  39.37 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 
286 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  38.65 
 
 
280 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  34.52 
 
 
270 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
271 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.16 
 
 
283 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  33.98 
 
 
289 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  33.73 
 
 
269 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  32.71 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.25 
 
 
296 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  29 
 
 
296 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
279 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
289 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
292 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
290 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.52 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
300 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  22.63 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.67 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 
285 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25.14 
 
 
444 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  22.17 
 
 
390 aa  52.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  21.9 
 
 
295 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
390 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  32.29 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  55.56 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  21.26 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  26.05 
 
 
418 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>