233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1903 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  51.14 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  50.36 
 
 		 273 aa  258  9e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  28.08 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  26.17 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  24.82 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  23.53 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1363  hypothetical protein  28.74 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.753164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  23.67 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  25.32 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  25.18 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  27.34 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  24.1 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  24.73 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  25.29 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  32.03 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  24.64 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  42.11 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1837  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  25.9 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  24.45 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  38.2 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  38.2 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  38.2 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  38.2 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  38.2 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  24.82 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.88 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  40.79 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  40.79 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  22.05 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1708  hypothetical protein  28.14 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  35.87 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  22.9 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  24.84 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.49 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  30.47 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  38.67 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  21.93 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  23.33 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  28.25 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1462  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0280424  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  29.13 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  32.33 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  23.22 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  23.77 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  27.92 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  28.76 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  37.18 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  38.04 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  34.07 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  28.71 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1987  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  22.42 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  22.42 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  31.11 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  22.42 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  22.42 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  22.42 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  35.92 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  22.42 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  22.42 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  28.71 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  24.38 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  35 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1593  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.196289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  40 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  28.35 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  35.29 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  22.42 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  27.66 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  30.52 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  23.58 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>