More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2318 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  51.26 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 256 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 209 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 210 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  45.3 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 224 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  46.02 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  44.25 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 228 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  43.75 
 
 		 212 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 214 aa  94.7  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 210 aa  94.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.59 
 
 		 204 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 210 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.67 
 
 		 212 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40.18 
 
 		 210 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 277 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  46.02 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 214 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 209 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 212 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 208 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 230 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 230 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  41.82 
 
 		 209 aa  90.1  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 214 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 233 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 210 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 214 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 220 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.32 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 212 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 207 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 330 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  39.2 
 
 		 200 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 212 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.48 
 
 		 202 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 214 aa  87  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.48 
 
 		 215 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  42.48 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 330 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 222 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 210 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 208 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 203 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 201 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 226 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>