108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3037 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1026    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5641  hypothetical protein  35.92 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.617076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  34.24 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  34.24 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  34.54 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3918  protein of unknown function DUF1214  31.77 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0604  hypothetical protein  29.68 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  32.2 
 
 		 506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  29.94 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  29.28 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2579  hypothetical protein  30.8 
 
 		 512 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02425  hypothetical protein  28.76 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3030  hypothetical protein  30 
 
 		 495 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  28.25 
 
 		 507 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3284  hypothetical protein  33.25 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133196  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5971  hypothetical protein  27.39 
 
 		 491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.346043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0264  hypothetical protein  26.65 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0593  hypothetical protein  27.71 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0910  hypothetical protein  28.45 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.190364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  28.22 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3839  protein of unknown function DUF1254  27.8 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190359  normal  0.11168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  24.82 
 
 		 798 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  25.44 
 
 		 481 aa  90.5  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  26.56 
 
 		 480 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  23.18 
 
 		 467 aa  86.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  25.15 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  25.97 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  23.67 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  24.37 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  25 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  25.28 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  25.06 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  24.11 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.28 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.28 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  23.25 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  24.51 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.75 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  23.86 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  23.66 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  23.37 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  24.34 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  26.88 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  22.25 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  25.12 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  25.43 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  25.15 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  24.38 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  23.29 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  25.56 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  20.88 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  25.32 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  26.2 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  23.47 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  23.58 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  24.88 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  23.33 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  25.3 
 
 		 478 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.33 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  23.36 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  31.62 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  29.86 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  23.59 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.2 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  24.06 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  36.63 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  23.75 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  23.37 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  23.16 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  23.08 
 
 		 491 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  21.23 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  31.36 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  22.89 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  22.74 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  32.73 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  28.7 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  21.52 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  29.84 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  21.46 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  21.75 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  32 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.78 
 
 		 490 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  27.78 
 
 		 449 aa  53.5  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  23.32 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  24.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  28.23 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  23.56 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  27.5 
 
 		 479 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  27.5 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  22.77 
 
 		 492 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  29.11 
 
 		 291 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  19.85 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  21.69 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  27.64 
 
 		 200 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  29.2 
 
 		 196 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  31.3 
 
 		 191 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  28.45 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  29.31 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>