More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2714 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1168 aa  2356    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  56.22 
 
 		 830 aa  256  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.59 
 
 		 820 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 759 aa  171  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 850 aa  166  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  31.74 
 
 		 1113 aa  161  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 1439 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 840 aa  157  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 1325 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 490 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1362 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 463 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  32.18 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 492 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  32.18 
 
 		 463 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  32 
 
 		 463 aa  148  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 827 aa  148  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 713 aa  147  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 450 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  27.94 
 
 		 717 aa  146  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 448 aa  145  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 713 aa  144  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 781 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 484 aa  144  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 489 aa  138  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 370 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 577 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 3706 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 844 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 844 aa  137  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  35.34 
 
 		 671 aa  136  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.67 
 
 		 680 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 		 619 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 703 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  31.67 
 
 		 680 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 795 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 703 aa  135  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 755 aa  134  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  34.1 
 
 		 799 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  32.71 
 
 		 1101 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  35.34 
 
 		 670 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.81 
 
 		 683 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 509 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.08 
 
 		 797 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 700 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 700 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 		 700 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 684 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 707 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 1226 aa  131  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.46 
 
 		 795 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 930 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 489 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 505 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 1229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 700 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.07 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 795 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 795 aa  129  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 784 aa  128  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  39.23 
 
 		 749 aa  128  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  30.35 
 
 		 687 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 374 aa  128  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 644 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 799 aa  126  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 909 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  36.68 
 
 		 662 aa  125  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 583 aa  125  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 541 aa  125  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 665 aa  125  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34.12 
 
 		 640 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 366 aa  124  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 662 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 359 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 801 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 485 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 873 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.02 
 
 		 368 aa  121  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 469 aa  121  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.39 
 
 		 1471 aa  121  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  34.29 
 
 		 515 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  29.45 
 
 		 900 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 658 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 671 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.34 
 
 		 980 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.579103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.6 
 
 		 458 aa  119  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 462 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 462 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 535 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  33.94 
 
 		 710 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  27.15 
 
 		 1154 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 382 aa  119  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  33.94 
 
 		 710 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  36.48 
 
 		 459 aa  119  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 541 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  41.73 
 
 		 490 aa  118  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>