More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1142 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  100 
 
 		 225 aa  470  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  80.8 
 
 		 225 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  80.72 
 
 		 223 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  76.44 
 
 		 224 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  75.23 
 
 		 221 aa  370  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  72.85 
 
 		 224 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  70.48 
 
 		 215 aa  324  5e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  63.98 
 
 		 220 aa  309  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  61.21 
 
 		 215 aa  296  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  61.61 
 
 		 216 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  60.95 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  60.75 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  61.06 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  61.14 
 
 		 213 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  58.64 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  58.96 
 
 		 212 aa  284  9e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.19 
 
 		 225 aa  279  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  58.02 
 
 		 212 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  58.9 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  57.48 
 
 		 223 aa  272  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  57.67 
 
 		 215 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.21 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  54.35 
 
 		 225 aa  268  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.88 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  56.42 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  55.05 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  55.5 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  55.5 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  55.5 
 
 		 217 aa  254  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  54.67 
 
 		 213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.21 
 
 		 215 aa  245  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.76 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  50.24 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  49.07 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.97 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  45.95 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.45 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.25 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  46.01 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  46.95 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  45 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  45.02 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  45.12 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  45 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  46.05 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  43.24 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  44.55 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  44.81 
 
 		 214 aa  188  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  45.07 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  42.79 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.21 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  42.4 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  40 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  39.34 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.59 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.92 
 
 		 232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  45.31 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.23 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  44.97 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  44.79 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  45.6 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  37.25 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  40.18 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  41 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  44.27 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  42.71 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.93 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  44.79 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  44.27 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.75 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.79 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  44.27 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.88 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  44.27 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  44.27 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.79 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  42.93 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  45.31 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  43.46 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  44.21 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.79 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  42.71 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  39.53 
 
 		 212 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  43.23 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  38.24 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  44.26 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  45.51 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  43.23 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  39.53 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  43.23 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  43.23 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  43.23 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  37.61 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  42.71 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.61 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>