More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1197 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 482 aa  984    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0659  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  88.12 
 
 		 500 aa  840    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2918  putative ATP-dependent RNA helicase  59.71 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.616126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1484  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.2 
 
 		 661 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104154  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1471  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.93 
 
 		 649 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.25269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3345  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.36 
 
 		 625 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.049503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2693  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.36 
 
 		 616 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1701  DEAD/DEAH box helicase-like  52.37 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0325  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.26 
 
 		 609 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1413  DEAD/DEAH box helicase-like  51.05 
 
 		 623 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.54 
 
 		 707 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1894  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.38 
 
 		 619 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.44 
 
 		 634 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.24 
 
 		 632 aa  395  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  48.2 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.97 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  49.75 
 
 		 608 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.67 
 
 		 627 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.67 
 
 		 627 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.76 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  45.43 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.89 
 
 		 454 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.88 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1652  putative ATP-dependent RNA helicase  43.39 
 
 		 537 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851991  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.61 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.22 
 
 		 453 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  45 
 
 		 516 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.61 
 
 		 512 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1584  ATP-dependent RNA helicase RhlE, putative  43.31 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.958576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.31 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.11 
 
 		 505 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  44.75 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.75 
 
 		 516 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2468  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 		 514 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.75 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2612  ATP-dependent RNA helicase  43.31 
 
 		 529 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2485  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.28 
 
 		 542 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.375937  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.08 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.38 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  44 
 
 		 513 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  46.23 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  44.44 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1082  ATP-dependent DEAD/DEAH box RNA-helicase  44.96 
 
 		 567 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.91 
 
 		 449 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.19 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.12 
 
 		 453 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.97 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  43.44 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.91 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.23 
 
 		 628 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.13 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.57 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.57 
 
 		 485 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.57 
 
 		 485 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.34 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.57 
 
 		 485 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  43.57 
 
 		 485 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.99 
 
 		 646 aa  295  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.57 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  41.99 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2404  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.52 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.785328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.04 
 
 		 480 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  41.77 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.39 
 
 		 513 aa  293  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  42.78 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.23 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.73 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.32 
 
 		 624 aa  292  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 486 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.34 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  40.17 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 479 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  42.78 
 
 		 486 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  40.91 
 
 		 641 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 		 486 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.37 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.69 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.1 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.63 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.27 
 
 		 565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.69 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.97 
 
 		 540 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  43.67 
 
 		 473 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  37.69 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.69 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  41.93 
 
 		 629 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  42.6 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.83 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.69 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.19 
 
 		 663 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  37.69 
 
 		 454 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.69 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>