More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3578 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  74.35 
 
 		 191 aa  291  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  67.02 
 
 		 189 aa  284  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  72.25 
 
 		 191 aa  277  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  64.77 
 
 		 192 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  69.19 
 
 		 196 aa  254  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  51.08 
 
 		 211 aa  220  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  48.69 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  52.27 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  48.97 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  50.57 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  50.57 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  50.57 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  50.57 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  50.57 
 
 		 195 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  49.43 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  49.71 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  49.13 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  49.13 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  49.13 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  49.13 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  49.13 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  43.62 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  49.13 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  49.12 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  46.28 
 
 		 189 aa  170  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  43.52 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  45.21 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  45.2 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  46.07 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  45.55 
 
 		 191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  48.21 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  45.31 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  45.24 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  46.43 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  45.83 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  46.67 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  44.5 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  46.43 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  46.55 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  46.51 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  41.8 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  45.24 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  43.71 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  38.34 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  40.11 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  40.43 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  38.1 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  36.17 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  42.27 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  38.32 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  40.98 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  38.24 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.86 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.86 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  37.1 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  39.88 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  35.62 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  38 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.41 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.74 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.61 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.94 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.94 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.6 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  37.35 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.26 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  38.31 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  33.15 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  34.07 
 
 		 205 aa  94.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.53 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  35.84 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  35.42 
 
 		 205 aa  94.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.19 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  34.52 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  36.57 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  33.7 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  33.53 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  33.33 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.57 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  35.8 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  33.92 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  32.94 
 
 		 216 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  32.65 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  34.04 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  36.73 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  36.73 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.22 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  35.6 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  36.73 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.57 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.31 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  36.73 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  35.23 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  36.73 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  41.07 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>