196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1673 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 681 aa  1403    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5169  hypothetical protein  38.35 
 
 		 704 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.882011  normal  0.19488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2590  cytochrome c peroxidase family protein, putative  35.26 
 
 		 773 aa  330  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.959599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4292  hypothetical protein  46.99 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.223034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  33.64 
 
 		 357 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  30.65 
 
 		 768 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  31.36 
 
 		 343 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  30.53 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  31.88 
 
 		 398 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  28.9 
 
 		 358 aa  88.6  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  29.32 
 
 		 399 aa  88.2  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.56 
 
 		 440 aa  88.2  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5805  Cytochrome-c peroxidase  33.79 
 
 		 571 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.181797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0005  cytochrome-c peroxidase  28.07 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  28.31 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  30.18 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  31.36 
 
 		 431 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  30.73 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  30.73 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  30.22 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  27.51 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  29.74 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1859  di-haem cytochrome c peroxidase  28.95 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  31.47 
 
 		 626 aa  81.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  27.39 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  30.91 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 365 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  27.74 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  28.63 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  27.85 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  29.22 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2895  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  27.15 
 
 		 337 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3035  Cytochrome-c peroxidase  31.49 
 
 		 401 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0428958  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  26.99 
 
 		 369 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.44 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  27.88 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4883  Di-heme cytochrome c peroxidase  30.37 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  26.47 
 
 		 427 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1885  Di-heme cytochrome c peroxidase  27.71 
 
 		 416 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0712604  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  26.8 
 
 		 339 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  25.21 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3462  di-haem cytochrome c peroxidase  29.2 
 
 		 361 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.835058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  26.89 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  26.05 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  27.85 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  27.93 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  24.47 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  26.61 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  25.34 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  25.34 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  25.34 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  25.33 
 
 		 351 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4868  di-haem cytochrome c peroxidase  27.69 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  24.43 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  26.24 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  28.04 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  26.55 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  24.43 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  27.35 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5007  cytochrome-c peroxidase  27.31 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4466  di-haem cytochrome c peroxidase  27.56 
 
 		 427 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0994  Cytochrome-c peroxidase  50 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184035  normal  0.251241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  23.53 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  23.53 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2642  di-haem cytochrome c peroxidase  28.03 
 
 		 409 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  28.49 
 
 		 465 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  25.79 
 
 		 330 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  25.4 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  24.65 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  24.43 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  27.81 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  28.51 
 
 		 390 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  24.56 
 
 		 355 aa  62  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  23.08 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.61 
 
 		 379 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1755  Cytochrome-c peroxidase  25.78 
 
 		 386 aa  62  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  23.45 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  26.46 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.73 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  26.46 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  26.46 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  25.26 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  25 
 
 		 371 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  26.94 
 
 		 463 aa  60.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  25.11 
 
 		 384 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3489  Cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  27.84 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  26.84 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  27.27 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  43.42 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  27.07 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>