89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1218 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  77.84 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  64.07 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  62.24 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  65.57 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  60.36 
 
 		 341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  60.36 
 
 		 341 aa  361  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  63.47 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  55.35 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  51.53 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  41.26 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.26 
 
 		 349 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  36.28 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  36.5 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  34.15 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  33.04 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  31.4 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  34.15 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  37.5 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  35.78 
 
 		 323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  35.03 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  35.03 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  34.66 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  27.74 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  30.96 
 
 		 318 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  33.54 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  34.62 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  32.8 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  32.92 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  30.97 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.03 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  28.08 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  28.1 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.7 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  27.24 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.73 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  26.76 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.77 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  25.67 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  29.22 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  27.54 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  30.09 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  29.8 
 
 		 943 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.2 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  28.36 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.75 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  23.77 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  28.49 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  28.49 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  28.37 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  28.06 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  23.75 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  28.06 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  26.88 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  26.93 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  24.91 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.3 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.83 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  25.99 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  20.98 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  24.54 
 
 		 257 aa  53.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  25.1 
 
 		 552 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  28.93 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.9 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  31.54 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  25.95 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  30.26 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  27.46 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  27.85 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  32.41 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.05 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  29.49 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  29.8 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  29.8 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.48 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  28.48 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  34.74 
 
 		 463 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  30.57 
 
 		 455 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>