77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1605 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  100 
 
 
322 aa  609  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  49.68 
 
 
318 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0291  Auxin Efflux Carrier  40.28 
 
 
317 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  30.12 
 
 
292 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  20.89 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.69 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  23.21 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.9 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  21.61 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  30.91 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  30.91 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.92 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.9 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.04 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2628  hypothetical protein  25.6 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.804416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.84 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  23.1 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2337  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  21.88 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.88 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.49 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.97 
 
 
318 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  25.97 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.81 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  22.4 
 
 
291 aa  49.3  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  23.79 
 
 
291 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  21.82 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.57 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  23.6 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.35 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.86 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.35 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.35 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  23.18 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  23.97 
 
 
311 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.59 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  22.83 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  19.73 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  19.73 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
313 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.38 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  21.55 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  22.89 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.7 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.7 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.7 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  27.44 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.27 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.17 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  21.82 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  20.89 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  20.09 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  23.22 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.34 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.21 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.2 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  20.61 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25.36 
 
 
306 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  20.42 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  22.8 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.16 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.81 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.08 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.56 
 
 
313 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  22.66 
 
 
291 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>