More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1435 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 553 aa  1123    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.45 
 
 		 558 aa  583  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  52.65 
 
 		 555 aa  581  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  53.05 
 
 		 555 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.74 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.06 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.13 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  45.56 
 
 		 552 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.19 
 
 		 553 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  46.14 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  45.84 
 
 		 549 aa  465  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  44.16 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.04 
 
 		 552 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.86 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  42.33 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.3 
 
 		 555 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  41.13 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  42.17 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  42.54 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  38.76 
 
 		 529 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  38.88 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  40.04 
 
 		 462 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  34.33 
 
 		 715 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 715 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  34.68 
 
 		 713 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 714 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 656 aa  77  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 658 aa  75.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 644 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 		 661 aa  73.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  30.2 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000466982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 638 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 658 aa  72  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 686 aa  70.5  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  24.04 
 
 		 641 aa  70.1  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  29.21 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 693 aa  68.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4525  threonyl-tRNA synthetase  28.14 
 
 		 659 aa  68.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.082511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 660 aa  67.8  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  23.53 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2044  threonyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 661 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  24.87 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  28.28 
 
 		 209 aa  67  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7169  threonyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  23.59 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1281  uridine kinase  28 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  27.12 
 
 		 634 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2598  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 675 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.311261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1924  threonyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 675 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0331233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  21.81 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2321  threonyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 675 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  24.29 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  22.45 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2211  threonyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2276  threonyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 675 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6323  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 670 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  23.73 
 
 		 659 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  21.81 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1422  uridine kinase  24.27 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  27.31 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  22.06 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 660 aa  60.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2364  uridine kinase  24.88 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 635 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.1 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0823  uridine kinase  27.78 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 		 633 aa  60.1  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1493  uridine kinase  25.24 
 
 		 196 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.54247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  21.31 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 687 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  21.43 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  21.84 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1378  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 673 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0410171  normal  0.0241813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  25.13 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2386  uridine kinase  27.23 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000694748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>