115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1411 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 391 aa  777    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1643  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1584  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  24.14 
 
 		 928 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  23.23 
 
 		 904 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.37 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  22.11 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  20.84 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  20.93 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  22.76 
 
 		 901 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.95 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.45 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 366 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  25.89 
 
 		 912 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  22.99 
 
 		 339 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  22.99 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  22.99 
 
 		 339 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  22.99 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  18.81 
 
 		 341 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  22.01 
 
 		 378 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  20.39 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  21.52 
 
 		 906 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  20.4 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  20.4 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  28 
 
 		 915 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  21.72 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  21.72 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  22.41 
 
 		 339 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.55 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.15 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  25.41 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  20.87 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  20.95 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  20.68 
 
 		 906 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  21.75 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  21.12 
 
 		 906 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  20.95 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  20.95 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  20.95 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  20.95 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.57 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  22.36 
 
 		 917 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  19.87 
 
 		 293 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  20.33 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.71 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  22.55 
 
 		 919 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  21.26 
 
 		 339 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  26.02 
 
 		 913 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  24.17 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  19.93 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.2 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.52 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  20.05 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  21.24 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.3 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  19.95 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  24.62 
 
 		 932 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  22.33 
 
 		 901 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  20.47 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  22.56 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 241 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  22.99 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  23.27 
 
 		 921 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 366 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.91 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>