More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1612 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
210 aa  420  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  80.09 
 
 
211 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  80.09 
 
 
211 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  83.41 
 
 
211 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  86 
 
 
200 aa  325  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.2 
 
 
211 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  78.2 
 
 
224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.73 
 
 
224 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.25 
 
 
224 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.62 
 
 
238 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  76.88 
 
 
214 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.34 
 
 
208 aa  274  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.77 
 
 
209 aa  252  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.17 
 
 
253 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.43 
 
 
206 aa  245  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.9 
 
 
214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.45 
 
 
208 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.29 
 
 
218 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50.25 
 
 
204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 
210 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.48 
 
 
203 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  52.24 
 
 
201 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.73 
 
 
207 aa  202  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.08 
 
 
204 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.24 
 
 
201 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.26 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.75 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  49.75 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.25 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.96 
 
 
206 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  47.24 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.85 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  43.78 
 
 
213 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.2 
 
 
192 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.64 
 
 
244 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  40.98 
 
 
206 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.64 
 
 
214 aa  148  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.59 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.55 
 
 
210 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.51 
 
 
206 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.13 
 
 
210 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.71 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.38 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.29 
 
 
208 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 
216 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.65 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.5 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  39.09 
 
 
229 aa  126  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 
238 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.34 
 
 
212 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  36.92 
 
 
474 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.83 
 
 
218 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.5 
 
 
576 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.07 
 
 
199 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  35.94 
 
 
470 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
339 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 
216 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.38 
 
 
243 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  34.54 
 
 
465 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.37 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.85 
 
 
241 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  34.38 
 
 
234 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  31.61 
 
 
228 aa  98.2  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 
478 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.83 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  31.5 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.76 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
274 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
252 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
252 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6028  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.98 
 
 
480 aa  92  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
252 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.76 
 
 
237 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.85 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.31 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
268 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 
255 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
222 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  28.28 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.94 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.64 
 
 
235 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2157  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.31 
 
 
488 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0242  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.246943  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3975  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.94 
 
 
457 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.69 
 
 
263 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.73 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.2 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.68 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00636  biopolymer transport protein  35.11 
 
 
453 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 
233 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001857  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.11 
 
 
453 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.92 
 
 
226 aa  84.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>