205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1414 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1108  acylase  59.52 
 
 		 813 aa  996    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  59.59 
 
 		 813 aa  999    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  61.86 
 
 		 824 aa  1058    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  61.86 
 
 		 824 aa  1063    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  62.88 
 
 		 816 aa  1088    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  59.06 
 
 		 813 aa  981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  73.96 
 
 		 847 aa  1321    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  73.72 
 
 		 847 aa  1310    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  72.25 
 
 		 839 aa  1258    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  48.55 
 
 		 848 aa  800    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  100 
 
 		 837 aa  1708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  59.52 
 
 		 813 aa  996    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  33.17 
 
 		 818 aa  350  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  31.08 
 
 		 829 aa  335  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  32.53 
 
 		 813 aa  332  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.88 
 
 		 821 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  30.74 
 
 		 804 aa  324  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  30.02 
 
 		 827 aa  310  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  30.49 
 
 		 803 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  29.93 
 
 		 810 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.87 
 
 		 855 aa  303  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  29.07 
 
 		 819 aa  301  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  28.91 
 
 		 821 aa  295  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  30 
 
 		 817 aa  294  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  29.11 
 
 		 827 aa  293  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  28.82 
 
 		 843 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  29.11 
 
 		 864 aa  290  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  27.64 
 
 		 819 aa  288  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.81 
 
 		 854 aa  284  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  31.06 
 
 		 783 aa  283  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  28.67 
 
 		 858 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  31.18 
 
 		 769 aa  280  7e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  30.54 
 
 		 779 aa  278  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.07 
 
 		 870 aa  277  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  27.07 
 
 		 796 aa  277  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  30.68 
 
 		 770 aa  276  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.83 
 
 		 796 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.07 
 
 		 796 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.82 
 
 		 796 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.82 
 
 		 796 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.4 
 
 		 796 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  29.5 
 
 		 844 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  26.98 
 
 		 796 aa  271  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  27.74 
 
 		 818 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  29.58 
 
 		 823 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.94 
 
 		 796 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  27.64 
 
 		 857 aa  267  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  28.81 
 
 		 809 aa  267  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  28.67 
 
 		 836 aa  266  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  26.95 
 
 		 796 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  29.76 
 
 		 789 aa  266  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  29.58 
 
 		 823 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  30.8 
 
 		 872 aa  265  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 856 aa  263  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.59 
 
 		 809 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  27.89 
 
 		 809 aa  262  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  29.6 
 
 		 792 aa  260  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.69 
 
 		 903 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  28.36 
 
 		 821 aa  258  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.21 
 
 		 795 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.84 
 
 		 889 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.69 
 
 		 795 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  27.73 
 
 		 823 aa  250  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.79 
 
 		 854 aa  249  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.94 
 
 		 906 aa  247  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 808 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 		 787 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  27.57 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  26.93 
 
 		 788 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  27.85 
 
 		 827 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  25.74 
 
 		 811 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.19 
 
 		 795 aa  235  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.46 
 
 		 788 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.35 
 
 		 806 aa  231  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.08 
 
 		 822 aa  231  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.4 
 
 		 795 aa  230  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.61 
 
 		 795 aa  230  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  29.43 
 
 		 818 aa  227  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.69 
 
 		 826 aa  227  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.74 
 
 		 821 aa  227  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.18 
 
 		 787 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  28.55 
 
 		 829 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.88 
 
 		 807 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.75 
 
 		 780 aa  224  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27 
 
 		 787 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  29.14 
 
 		 786 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.92 
 
 		 812 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  27.8 
 
 		 774 aa  219  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.03 
 
 		 809 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.03 
 
 		 809 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.76 
 
 		 847 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  28.83 
 
 		 784 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  27.2 
 
 		 837 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  27.2 
 
 		 837 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  27.2 
 
 		 837 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  28.93 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  27.09 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  27.09 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  27.09 
 
 		 837 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>