More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2031 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 363 aa  752    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  87.05 
 
 		 363 aa  662    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  86.5 
 
 		 363 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  76.45 
 
 		 363 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  76.18 
 
 		 381 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  86.17 
 
 		 312 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2380  peptide chain release factor 2  95.98 
 
 		 249 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  53.76 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  53.47 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  50.83 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  50.43 
 
 		 371 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  48.4 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  48.98 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  49.41 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  48.24 
 
 		 372 aa  342  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  51.6 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  46.47 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 349 aa  339  4e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  48.54 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.4 
 
 		 361 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  49.42 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 380 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 380 aa  335  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  47.98 
 
 		 364 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  50.74 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  49.27 
 
 		 380 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  48.85 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.51 
 
 		 371 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  47.97 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  51.53 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.71 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  47.2 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  52.37 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  48.22 
 
 		 371 aa  328  6e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  49.26 
 
 		 368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  46.63 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.8 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  47.83 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  47.54 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  46.48 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  45.74 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  52.05 
 
 		 326 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 330 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.9 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0054  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 371 aa  325  6e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  45.33 
 
 		 382 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  46.86 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  51.74 
 
 		 326 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  45.83 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  47.2 
 
 		 365 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  48.31 
 
 		 369 aa  323  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  44.84 
 
 		 373 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  48.44 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  46.9 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  51.2 
 
 		 337 aa  323  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  48.71 
 
 		 374 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  46.31 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 		 391 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  48.22 
 
 		 357 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.8 
 
 		 369 aa  322  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  46.48 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  46.44 
 
 		 357 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  46.51 
 
 		 365 aa  319  3.9999999999999996e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  46.15 
 
 		 332 aa  319  6e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  46.55 
 
 		 364 aa  319  6e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.45 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  46.02 
 
 		 359 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.28 
 
 		 329 aa  318  7.999999999999999e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.63 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0241  peptide chain release factor 2  46.89 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  48.68 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 340 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 		 367 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2878  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 		 364 aa  315  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0456  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 338 aa  315  7e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.454858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.19 
 
 		 317 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 		 367 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  50.17 
 
 		 304 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.54 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>