83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1930 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  100 
 
 		 466 aa  959    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  29.11 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  26.68 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  27.19 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  24.13 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 490 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 		 934 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  25.44 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  22.15 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  24.7 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  25.3 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  20.61 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.47 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.18 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  23.7 
 
 		 1812 aa  60.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.75 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.66 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  21.43 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 963 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  20.81 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  27.62 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.2 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 322 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.52 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.52 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.52 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.52 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  27.2 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  22.97 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.73 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.13 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.71 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  27.63 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.86 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 484 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  21.34 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  29.55 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.44 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  30.86 
 
 		 349 aa  48.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.51 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  21.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  22.99 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.24 
 
 		 774 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  22.08 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.65 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.14 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.8 
 
 		 1454 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  21.71 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  22.45 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  21.33 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.19 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.15 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  21.8 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 619 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  25.26 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.19 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  21.75 
 
 		 557 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1254  Pyrrolo-quinoline quinone  28.04 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  21.14 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  22.08 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 643 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  27.15 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  21.09 
 
 		 371 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.93 
 
 		 393 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  22.81 
 
 		 352 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  32.17 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  36.36 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  36.36 
 
 		 509 aa  43.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  20.83 
 
 		 705 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>