155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0673 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
280 aa  585  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.75 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.85 
 
 
278 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.21 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.8 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 
276 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  27.41 
 
 
276 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.02 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  27.06 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.8 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  25.76 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  25.09 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  27.6 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  25.87 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  25.87 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  27.2 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  24.73 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.73 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.73 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  26.82 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  27.43 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  26.82 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.46 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  29.57 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  28.32 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.12 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  25.08 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.08 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.07 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  25.08 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.16 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.72 
 
 
296 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  25.58 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  23.89 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.9 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.26 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.05 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.41 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.18 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.1 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  25.86 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.93 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.12 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.8 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.39 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.15 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.63 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.56 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.38 
 
 
372 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  29.05 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.92 
 
 
282 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.68 
 
 
394 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.81 
 
 
289 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.53 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.69 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  23.39 
 
 
296 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.91 
 
 
394 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  21.72 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.45 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.84 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.45 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.77 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.8 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  35.06 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 
306 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.06 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.06 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  27.23 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  25.91 
 
 
241 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  22.18 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.28 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.18 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.58 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  22.18 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>