More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2415 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2415  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 587 aa  1194    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1850  peptidoglycan glycosyltransferase  49.91 
 
 		 614 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6180  division-specific transpeptidase, penicillin-binding protein  49.81 
 
 		 582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1273  peptidoglycan glycosyltransferase  48.67 
 
 		 585 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.912676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1045  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.11 
 
 		 579 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2188  peptidoglycan glycosyltransferase  48.3 
 
 		 582 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4054  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.36 
 
 		 584 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2013  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.61 
 
 		 574 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3400  peptidoglycan glycosyltransferase  46.79 
 
 		 584 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210929  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3479  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.57 
 
 		 599 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1988  peptidoglycan glycosyltransferase  46.6 
 
 		 584 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0686  peptidoglycan glycosyltransferase  46.42 
 
 		 614 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1738  peptidoglycan glycosyltransferase  44.38 
 
 		 594 aa  475  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.429704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4639  peptidoglycan glycosyltransferase  48.22 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0570885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5102  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.22 
 
 		 625 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2088  peptidoglycan glycosyltransferase  46.1 
 
 		 582 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2860  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.71 
 
 		 586 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49605  normal  0.0126787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1437  penicillin-binding protein  43.88 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.735736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2600  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.34 
 
 		 586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595508  normal  0.773053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5178  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.42 
 
 		 602 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1394  penicillin-binding protein  43.88 
 
 		 607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5469  penicillin-binding protein transpeptidase  46.44 
 
 		 595 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00596521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0956  peptidoglycan glycosyltransferase  44.82 
 
 		 599 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0261  peptidoglycan glycosyltransferase  47.11 
 
 		 600 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2363  peptidoglycan glycosyltransferase  46.55 
 
 		 630 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0360882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5367  peptidoglycan glycosyltransferase  45.12 
 
 		 577 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.451655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0953  putative penicillin binding protein  43.75 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2897  penicillin binding protein 2  43.01 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9532  penicillin-binding protein  41.22 
 
 		 585 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110863  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  44.36 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.765677  normal  0.258337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2767  peptidoglycan glycosyltransferase  43.35 
 
 		 593 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29633  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2017  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 		 593 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3176  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.01 
 
 		 682 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0774  peptidoglycan glycosyltransferase  41.23 
 
 		 597 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0631389  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_002978  WD1273  penicillin-binding protein  40.25 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.603055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2098  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.23 
 
 		 597 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00289647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1887  peptidoglycan glycosyltransferase  42.99 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0305107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3953  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 		 579 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2472  peptidoglycan synthetase ftsI precursor  39.96 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.431937  normal  0.436915 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0057  peptidoglycan glycosyltransferase  40.55 
 
 		 696 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0585  peptidoglycan glycosyltransferase  38.69 
 
 		 601 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821878  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0685  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146126  normal  0.329198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1127  peptidoglycan glycosyltransferase  42.94 
 
 		 581 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.322887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3673  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 584 aa  356  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165211  normal  0.119703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2241  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 646 aa  332  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.69 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.4 
 
 		 703 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 654 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 561 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  32.79 
 
 		 622 aa  247  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 588 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.22 
 
 		 657 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  33.15 
 
 		 644 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 614 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.21 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 631 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 675 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 662 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 657 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  30.7 
 
 		 646 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 705 aa  236  8e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.19 
 
 		 711 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.87 
 
 		 657 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.87 
 
 		 583 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  31.69 
 
 		 740 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.45 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 578 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 710 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.88 
 
 		 689 aa  230  6e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  33.4 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  33.4 
 
 		 579 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 		 576 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 645 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 613 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.46 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.83 
 
 		 695 aa  228  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  31.4 
 
 		 570 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 586 aa  227  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 583 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05751  peptidoglycan synthetase  29.81 
 
 		 598 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.14 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 704 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 575 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 575 aa  223  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 607 aa  223  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1850  putative peptidoglycan synthetase (pbp transpeptidase domain)  29.25 
 
 		 598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.570485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.32 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 556 aa  220  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  30.73 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.67 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>