More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1798 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  36.82 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  31.78 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  30 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  29.39 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  27.85 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  28.99 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.23 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4716  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  26.67 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  28.27 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.24 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  25 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.2 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  25.51 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2422  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  26.52 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2412  IclR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  22.83 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.66 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.04 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.54 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  21.72 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  23.57 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.36 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3765  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0150652 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  27.83 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  28.91 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  26.83 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  25.86 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.73 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  25.66 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.3 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.82 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  27.36 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.49 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  25.21 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  26.51 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  22.04 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  26.07 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.36 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  23.32 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.36 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  26.42 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>