More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1086 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  247  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 256 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  41.51 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  44.12 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 208 aa  88.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  39.66 
 
 		 228 aa  87.4  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 208 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 214 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 277 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 230 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  39.22 
 
 		 209 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 230 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 224 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  42.86 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  41.35 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  38.26 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 241 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.18 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  38.1 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5188  response regulator receiver protein  40.4 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701464 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 210 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  40.59 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  41.58 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  37.96 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  34.55 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>