56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1654 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1654  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 172 aa  347  7e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00738213 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0681  putative RNA-binding protein  70.18 
 
 		 172 aa  264  4e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.384245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1989  putative RNA-binding protein  68.02 
 
 		 174 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0597  putative RNA-binding protein  64.46 
 
 		 168 aa  231  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0310  PUA domain-containing protein  44.3 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1050  PUA domain-containing protein  35.33 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0861537  decreased coverage  0.00000000242397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0397  putative RNA-binding protein  34.97 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0688131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3058  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0148  putative RNA-binding protein  31.72 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.026046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0092  putative RNA-binding protein  31.97 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0695  PUA domain-containing protein  42.22 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0231  putative RNA-binding protein  30.81 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.422543  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0751  putative RNA-binding protein  32.87 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0461148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  35.92 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  35.92 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  35.92 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  31.48 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0973  Protein of unknown function DUF1947  36.27 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0193  putative RNA-binding protein  28.05 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0504341 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0233  putative RNA-binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161468  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0035  putative RNA-binding protein  30.3 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0118889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  35.2 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1481  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0427  PUA domain containing protein  30.72 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3096  PUA domain containing protein  31.45 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43572  predicted protein  27.45 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.291748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  28.4 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  33.08 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53664  predicted protein  30.28 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.24175  normal  0.0700588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0141  putative RNA-binding protein  28.23 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10175  PUA RNA binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09810)  27.27 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01450  hypothetical protein  24.67 
 
 		 253 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28705  predicted protein  25.43 
 
 		 564 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  32.99 
 
 		 373 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16787  predicted protein  24.81 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  25.55 
 
 		 331 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10140  glutamate 5-kinase  38.33 
 
 		 401 aa  44.7  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.268625  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  32 
 
 		 233 aa  44.3  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.82 
 
 		 333 aa  44.3  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  24.26 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.63 
 
 		 580 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3186  gamma-glutamyl kinase  30.51 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  35.62 
 
 		 321 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3377  glutamate 5-kinase  25.44 
 
 		 385 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  32.22 
 
 		 388 aa  42  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  31.03 
 
 		 373 aa  41.6  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  35 
 
 		 377 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  28.79 
 
 		 367 aa  40.8  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>