More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0684 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0684  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 228 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.11 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.51 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.31 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.09 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.3 
 
 		 266 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.32 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.04 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.84 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 294 aa  99  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 268 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 266 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  29.58 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  29.65 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 273 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.39 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.39 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.39 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.39 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 283 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.54 
 
 		 490 aa  93.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.39 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31 
 
 		 513 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.35 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.23 
 
 		 265 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  26.87 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.39 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.64 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 254 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 277 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.61 
 
 		 290 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 		 273 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  29.19 
 
 		 456 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  25.93 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  28.18 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  27.95 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  28.76 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  27.85 
 
 		 714 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.38 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  25.93 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.5 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  25.93 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  25.89 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 284 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 270 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 286 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  30.3 
 
 		 260 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.76 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.43 
 
 		 273 aa  88.2  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.55 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>