More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1972 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1972  type II secretion system protein  100 
 
 		 395 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  72.98 
 
 		 396 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3424  type II secretion system protein  68.09 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2338  type II secretion system protein  68.34 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2516  type II secretion system protein  68.34 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2793  type II secretion system protein  66.92 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1433  type II secretion system protein F  49.87 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1342  type II secretion system protein  50.75 
 
 		 395 aa  352  8e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1294  type II secretion system protein F  49.35 
 
 		 389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0082723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2420  type II secretion system protein  45.71 
 
 		 393 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3879  type II secretion system protein  46.19 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2589  type II secretion system protein  43.54 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02971  general secretion pathway GSPF-like transmembrane protein  44.97 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3222  type II secretion system protein  42.05 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.333811 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2309  putative GSPF-related transmembrane protein  38.15 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281801  normal  0.163088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1432  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4712  Type II secretory pathway, gspf-related transmembrane protein  37.86 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.992517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2613  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.95954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.58 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1865  type II secretion system protein  33.6 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  33.63 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  32.41 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1450  type II secretion system protein  32.48 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  30.7 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1784  type IV pilus biogenesis protein PilC, putative  32.76 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1045  general secretion pathway protein F  31.42 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  32.07 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  28.3 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1278  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  33.25 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  33.5 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.55 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  31.27 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0130  type II secretory pathway, component PulF  32.82 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0593  general secretion pathway protein F  31.38 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2922  general secretion pathway protein F  28.82 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3617  general secretion pathway protein F  32.34 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00345  putative general secretion pathway GSPF-related transmembrane protein  33.33 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.604529 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 439 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  28.29 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  31.37 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4732  general secretion pathway protein F  32.05 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0181431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  31.12 
 
 		 410 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  29.28 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  28.29 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  32.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02677  general secretion pathway protein F  30.53 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.34 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1575  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377421  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  29.43 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2392  general secretion pathway protein F  32.61 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000517266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  32.34 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.91 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  32.1 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0123  general secretion pathway protein F  31.09 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  33.92 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1071  general secretion pathway protein F  33.06 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  30 
 
 		 410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  32.35 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  32.35 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  32.35 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  26.68 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  32.02 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  32.02 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  32.1 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  32.1 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  27.16 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1350  general secretion pathway protein F  31.47 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  32.1 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  32.94 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  27.87 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0099  general secretion pathway protein F  29.78 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  30.15 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4356  general secretion pathway protein F  32.65 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 405 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  28.2 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>