71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1344 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  87.41 
 
 		 143 aa  246  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  75 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  72.73 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3090  DoxX family protein  57.78 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1187  DoxX family protein  56.3 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  50 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2799  DoxX family protein  54.14 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  50 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  48.06 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  51.64 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  44.19 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  46.88 
 
 		 128 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  41.18 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  40 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  44.8 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  39.06 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0915  DoxX  45.76 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  46.09 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  40.3 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  41.22 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  41.94 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  45.05 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  39.53 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2122  DoxX family protein  41.38 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3963  DoxX family protein  42.48 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  39.69 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  36.15 
 
 		 127 aa  90.1  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1594  DoxX  44.55 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570785  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  43.33 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  35.34 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  35.88 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1661  DoxX  37.4 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.430613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.68 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.4 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0176  SRC kinase associated phosphoprotein 2  26.55 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.479419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  36.22 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  38.21 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  38.21 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  38.21 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  37.59 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  38.64 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  38.64 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  34.38 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  28.57 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  34.75 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.23 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  29.41 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.16 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  30.43 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  29.57 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  32.79 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  30.08 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  35.21 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  33.33 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  29.69 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  30.15 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  30.15 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  33.08 
 
 		 147 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.01 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  28.78 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  33.33 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  29.41 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  39.44 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  34.48 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  32.33 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  33.33 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  30.4 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>