More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1055 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  54.5 
 
 		 729 aa  811    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  57.02 
 
 		 724 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.27 
 
 		 728 aa  800    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  57.16 
 
 		 724 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  57.16 
 
 		 724 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  57.02 
 
 		 724 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  100 
 
 		 747 aa  1531    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  48.91 
 
 		 735 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  54.77 
 
 		 729 aa  815    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  54.13 
 
 		 729 aa  805    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  56.73 
 
 		 724 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  46.66 
 
 		 714 aa  631  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3276  TonB-dependent siderophore receptor  40.78 
 
 		 840 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  38.29 
 
 		 766 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2733  TonB-dependent siderophore receptor  36.33 
 
 		 747 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000321343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2812  TonB-dependent siderophore receptor  36.54 
 
 		 747 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215946  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1653  TonB-dependent siderophore receptor  36.44 
 
 		 741 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0605702  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 827 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2711  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 		 741 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  38.38 
 
 		 722 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3496  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 723 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 		 737 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.486485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  37.92 
 
 		 723 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  38.69 
 
 		 802 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  36.18 
 
 		 696 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 		 731 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  37.84 
 
 		 722 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1517  TonB-dependent siderophore receptor  36.28 
 
 		 737 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134645  normal  0.877607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 729 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3033  ferric alcaligin siderophore receptor  38.18 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  36.72 
 
 		 733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 803 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1451  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1507  TonB-dependent siderophore receptor  36.41 
 
 		 737 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.681157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1482  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 723 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 		 801 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  37.27 
 
 		 722 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 693 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2121  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 		 693 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000812539  normal  0.443663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  37.5 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  38.23 
 
 		 816 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4556  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 		 720 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2539  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 753 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2440  FhuE receptor  35.03 
 
 		 753 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2192  TonB-dependent siderophore receptor  36.67 
 
 		 725 aa  435  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0137  TonB-dependent iron-siderophore receptor precursor  34.56 
 
 		 721 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  35.81 
 
 		 815 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 806 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  35.21 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  33.83 
 
 		 795 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.94 
 
 		 789 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  37.33 
 
 		 803 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  34.12 
 
 		 812 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3182  TonB-dependent receptor family protein  34.63 
 
 		 699 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.223092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 798 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  34.83 
 
 		 807 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 		 814 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  35.19 
 
 		 819 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3531  TonB-dependent siderophore receptor  34.61 
 
 		 740 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313722  decreased coverage  0.00643483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1501  TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 732 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.125781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1999  outer membrane receptor for Fe  34.01 
 
 		 706 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.928723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2583  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 748 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1326  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624497  normal  0.0240469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3097  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 723 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  36.6 
 
 		 812 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  34.76 
 
 		 810 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2724  FhuE receptor  33.86 
 
 		 707 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  35.29 
 
 		 717 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1082  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 		 730 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 722 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2000  outer membrane receptor for Fe  33.53 
 
 		 706 aa  374  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  34.02 
 
 		 802 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 765 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 		 765 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 		 722 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0603  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 716 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00298801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 		 824 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0873  outer membrane receptor for Fe  33.38 
 
 		 712 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.474088  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 765 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 718 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 724 aa  360  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 833 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.39 
 
 		 712 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4286  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 728 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3717  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 726 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0114  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 728 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0106  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 728 aa  350  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2549  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 700 aa  350  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4426  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 728 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4535  TonB-dependent siderophore receptor  34.92 
 
 		 778 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 822 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  34.25 
 
 		 841 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  32.94 
 
 		 697 aa  336  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>