More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5076 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  64.41 
 
 		 551 aa  707    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  100 
 
 		 538 aa  1082    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  56.37 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  56.68 
 
 		 551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  55.77 
 
 		 540 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  55.58 
 
 		 540 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  55.95 
 
 		 543 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  55.58 
 
 		 543 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  55.29 
 
 		 543 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  52.13 
 
 		 545 aa  536  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  52.65 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  51.79 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.07 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  47.07 
 
 		 613 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 		 611 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.69 
 
 		 613 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  48.79 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  47.7 
 
 		 608 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  48.52 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  48.21 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 		 614 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  49.72 
 
 		 531 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 		 546 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.9 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  48.86 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  49.05 
 
 		 624 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  49.05 
 
 		 624 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  48.55 
 
 		 621 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  45.51 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  48.55 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  47.29 
 
 		 553 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  45.13 
 
 		 551 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  45.95 
 
 		 665 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.65 
 
 		 582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  46.08 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  45.71 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  42.91 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.44 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  41.17 
 
 		 592 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  40.56 
 
 		 548 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  37.59 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  37.21 
 
 		 609 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  40.6 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  40.41 
 
 		 592 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.28 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  38.08 
 
 		 593 aa  347  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  38.99 
 
 		 535 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  37.92 
 
 		 557 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  38.06 
 
 		 547 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  39.96 
 
 		 547 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.45 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  36.56 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.59 
 
 		 661 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.53 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  33.86 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.26 
 
 		 583 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  36.51 
 
 		 588 aa  339  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  39.43 
 
 		 546 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  39.17 
 
 		 619 aa  339  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  36.41 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  40.12 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  37.5 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  35.05 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  38.65 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  37.5 
 
 		 619 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  38.23 
 
 		 532 aa  337  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  38.45 
 
 		 557 aa  337  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.73 
 
 		 596 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  37.63 
 
 		 571 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 524 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  38.94 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  38.4 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  34.34 
 
 		 619 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  35.91 
 
 		 573 aa  335  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  38.85 
 
 		 559 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  38.37 
 
 		 532 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  36.98 
 
 		 555 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  38.01 
 
 		 565 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  38.85 
 
 		 559 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  38.85 
 
 		 559 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  38.74 
 
 		 565 aa  333  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  35.62 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  33.77 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  37.12 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  34.64 
 
 		 565 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  34.92 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  38.08 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.78 
 
 		 619 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 602 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  39.69 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 539 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  40.12 
 
 		 527 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  39.89 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  37.06 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.94 
 
 		 564 aa  330  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>