191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1277 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  886    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  42.49 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  38.54 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  35.37 
 
 		 379 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  56.22 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  46.67 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  29.52 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  39.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  39.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.1 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  39.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  39.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  39.66 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  39.29 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  28.26 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  28.26 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  34.06 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  46.75 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  35.59 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  33.59 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  39.19 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  26.9 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.14 
 
 		 487 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  34.19 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  32.8 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60552  Azole resistance protein 1  30 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 426 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  33.33 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  36.59 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 		 554 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01766  MFS multidrug efflux transporter (Eurofung)  36.07 
 
 		 636 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  30.88 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  31.03 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  30.88 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  30.88 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  33.72 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  35.14 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.84 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  35.14 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>