77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2748 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0379  17 kDa surface antigen  60.39 
 
 		 156 aa  202  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0789  17 kDa surface antigen  60.18 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0930  17 kDa surface antigen  60 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2584  surface antigen protein  45.21 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0311  common antigen precursor-like protein  49.53 
 
 		 425 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000389869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1122  17 kDa surface antigen  46.51 
 
 		 430 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0626  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.245463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1122  17 kDa surface antigen  42.86 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.527278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0579  17 kDa surface antigen  40.13 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.313574  hitchhiker  0.00000000000560839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1843  17 kDa surface antigen  35.95 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000317779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0351  17 kDa surface antigen  36.6 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0572  17 kDa common-antigen  37.97 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000192664  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1585  surface antigen  37.97 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.82474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0776  hypothetical protein  42.58 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0805  hypothetical protein  42.58 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1189  LipA a lipoprotein  41.3 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.788646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1832  LipA a lipoprotein  38.3 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00124882  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_004310  BR0606  outer membrane lipoprotein-related protein  39.18 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.293548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0605  outer membrane lipoprotein-related protein  39.18 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1999  LipA a lipoprotein  35.87 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.436971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  28.24 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1879  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3452  LipA a lipoprotein  35.87 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3912  SH3 type 3 domain-containing protein  34.75 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4146  SH3 type 3 domain-containing protein  33.61 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1245  hypothetical protein  33.61 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0601719  normal  0.653763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1274  SH3 type 3 domain-containing protein  33.61 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1435  LipA a lipoprotein  35.87 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1259  putative surface antigen precursor  30.68 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0198183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0896  hypothetical protein  34.83 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2345  17 kDa surface antigen  42.45 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1308  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1361  lipoic acid synthetase  41.43 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2464  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0632  putative outer-membranne lipoprotein  34.04 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0962709  normal  0.80655 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2672  outer membrane lipoprotein-related protein  37.89 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1206  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.651537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2128  LipA a lipoprotein  33.65 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1137  hypothetical protein  29.11 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1390  hypothetical protein  29.6 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4812  hypothetical protein  27.27 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  0.12074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4031  hypothetical protein  28.28 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4294  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4663  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.185035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0766  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4756  hypothetical protein  29.29 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1087  hypothetical protein  25.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0623  hypothetical protein  33.9 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.226854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1107  hypothetical protein  29.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.659248  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1069  hypothetical protein  26.73 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3948  hypothetical protein  24.75 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  normal  0.916916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  39.29 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1068  outer membrane lipoprotein-related protein  31.91 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3178  LipA a lipoprotein  28.57 
 
 		 145 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.065158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0919  outer membrane lipoprotein-related protein  31.91 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.439751  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  42.86 
 
 		 189 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  39.22 
 
 		 272 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  45.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0250  17 kDa surface antigen  37.86 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315994  normal  0.537403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  37.5 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  38.1 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>