124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1939 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  100 
 
 		 517 aa  1083    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  46.36 
 
 		 502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  42.89 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  44.73 
 
 		 498 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  41.83 
 
 		 499 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  42.42 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  42.21 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  41.59 
 
 		 503 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  36.09 
 
 		 514 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  36.17 
 
 		 499 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.88 
 
 		 538 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.88 
 
 		 538 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.73 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  35.52 
 
 		 499 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.72 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  35.77 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  32.64 
 
 		 538 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  36.19 
 
 		 507 aa  266  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  36.52 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  32.44 
 
 		 538 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  35.26 
 
 		 505 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  34.05 
 
 		 503 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  34.27 
 
 		 508 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.61 
 
 		 495 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.57 
 
 		 498 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.49 
 
 		 511 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  36.13 
 
 		 497 aa  259  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.82 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  32.85 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.71 
 
 		 505 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.87 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.2 
 
 		 504 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.19 
 
 		 526 aa  256  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 497 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  32.9 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 506 aa  253  5.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  33.95 
 
 		 531 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  34.69 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.48 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 492 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.84 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.13 
 
 		 496 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  34.02 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  34.52 
 
 		 528 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.93 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  34.11 
 
 		 505 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  31.34 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.69 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.38 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  35.92 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 510 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.32 
 
 		 529 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.84 
 
 		 512 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33 
 
 		 518 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  32.29 
 
 		 513 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  33.62 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  33.91 
 
 		 505 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  35.58 
 
 		 515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.19 
 
 		 740 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.76 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  32.93 
 
 		 543 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  34.57 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 543 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  32.9 
 
 		 501 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.1 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  33.13 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 507 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  32.72 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  33.54 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  32.33 
 
 		 515 aa  238  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.84 
 
 		 502 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  32.1 
 
 		 511 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 513 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  31.69 
 
 		 524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  30.72 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  32.89 
 
 		 507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  31.54 
 
 		 523 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  33.95 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.64 
 
 		 513 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>