131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0803 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  100 
 
 		 506 aa  1061    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  44.49 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  43.37 
 
 		 517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  43.58 
 
 		 498 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  41.78 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  41.58 
 
 		 501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  41.22 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  41.15 
 
 		 499 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  36.58 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  35.29 
 
 		 510 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.37 
 
 		 538 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.57 
 
 		 538 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.57 
 
 		 538 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.21 
 
 		 538 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.04 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.62 
 
 		 501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 538 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  35.23 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  35.56 
 
 		 506 aa  282  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.93 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.8 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.73 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  34.18 
 
 		 501 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 503 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 503 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  35.71 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.74 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  36.48 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 500 aa  270  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  33.73 
 
 		 500 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  34.19 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  37.47 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  32.67 
 
 		 496 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.33 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  32.45 
 
 		 529 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  33.73 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  32.07 
 
 		 529 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 507 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 494 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.6 
 
 		 740 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  32.73 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  37.96 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  31.27 
 
 		 507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  32.28 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  34.78 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.28 
 
 		 499 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  32.74 
 
 		 497 aa  256  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  32.26 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  32.8 
 
 		 502 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 508 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.21 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  33.99 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  33.9 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.72 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  35.14 
 
 		 527 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.14 
 
 		 502 aa  249  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.34 
 
 		 504 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  36 
 
 		 507 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.8 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  31.63 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.89 
 
 		 514 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  33.73 
 
 		 498 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  31.05 
 
 		 523 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  31.99 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  32.15 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 512 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  31.95 
 
 		 507 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  35.44 
 
 		 507 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  32.98 
 
 		 508 aa  240  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  32.42 
 
 		 511 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 514 aa  239  8e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  31.98 
 
 		 524 aa  239  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 497 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  32.11 
 
 		 507 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  31.3 
 
 		 496 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  32.71 
 
 		 524 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  32.7 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  34.34 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  34.68 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  31.99 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  34.54 
 
 		 510 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  32.92 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>