More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1511 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  678    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  81.29 
 
 		 327 aa  565  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  81.06 
 
 		 330 aa  555  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  80.75 
 
 		 329 aa  547  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  54.49 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  37.26 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  39.14 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  36.01 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  37.38 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.91 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  31.67 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  34.08 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  32.47 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.27 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  38.36 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  31.45 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.29 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  36.81 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  31.95 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  29.49 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  32.52 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  30.33 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  31.9 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  31.61 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  30.58 
 
 		 422 aa  132  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  32.29 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.77 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.41 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  30.86 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  30.56 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  28.16 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  29.07 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  29.05 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  28.85 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  29.07 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.03 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  28.9 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  28.79 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  26.27 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  31.23 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  24.19 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  24.52 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  30.72 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  27.88 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.08 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  29.54 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  28.14 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  25.85 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  25.17 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  26.69 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  26.85 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.3 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  31.82 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.8 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  29.69 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  31.2 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.76 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3730  C32 tRNA thiolase  27.94 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  31.2 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  28.04 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  23.57 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  24.79 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  25.62 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  25.62 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  26.32 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  25.94 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  27.31 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  26.05 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  27.64 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  25.28 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.69 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  26.39 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  25.28 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  25.88 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  26.23 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  27.24 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  25.83 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4089  C32 tRNA thiolase  27.14 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  28.92 
 
 		 252 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  27.16 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>