More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1001 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
196 aa  403  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  92.81 
 
 
182 aa  334  5.999999999999999e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.62 
 
 
192 aa  300  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  94.01 
 
 
183 aa  284  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.54 
 
 
374 aa  211  7.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.7 
 
 
147 aa  190  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.71 
 
 
145 aa  189  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.45 
 
 
144 aa  185  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.21 
 
 
147 aa  184  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 
171 aa  180  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.69 
 
 
170 aa  174  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.69 
 
 
170 aa  174  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  54.89 
 
 
174 aa  166  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.62 
 
 
176 aa  148  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  44.16 
 
 
184 aa  147  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  45.73 
 
 
271 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  43.62 
 
 
166 aa  143  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  46.04 
 
 
173 aa  143  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  45.71 
 
 
211 aa  142  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  45.57 
 
 
176 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  45.57 
 
 
174 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  47.06 
 
 
177 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 
174 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  46.04 
 
 
184 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  47.83 
 
 
191 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 
177 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.48 
 
 
180 aa  141  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  45.89 
 
 
186 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  45.06 
 
 
264 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  47.62 
 
 
182 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.3 
 
 
184 aa  140  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.79 
 
 
188 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  46.15 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  45.14 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  44.59 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  44.59 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.94 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.59 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  44.3 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  44 
 
 
235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.76 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  43.11 
 
 
173 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.76 
 
 
170 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  45.7 
 
 
190 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
184 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.12 
 
 
176 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
184 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.69 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.28 
 
 
200 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  43.42 
 
 
247 aa  138  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1069  NADH dehydrogenase subunit B  43.79 
 
 
250 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.523866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  45.32 
 
 
173 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  45.32 
 
 
170 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1040  NADH dehydrogenase subunit B  43.79 
 
 
250 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  45.59 
 
 
228 aa  137  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  44.1 
 
 
249 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  44.1 
 
 
249 aa  137  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.28 
 
 
200 aa  138  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  47.48 
 
 
179 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  45.14 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.48 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  47.89 
 
 
184 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.55 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  47.06 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  43.71 
 
 
250 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
158 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
158 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.85 
 
 
207 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  42.21 
 
 
184 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.59 
 
 
251 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  45.52 
 
 
193 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  47.18 
 
 
184 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03161  NADH dehydrogenase subunit B  43.42 
 
 
244 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0204  NADH dehydrogenase subunit B  45.99 
 
 
246 aa  136  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0271825  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03171  NADH dehydrogenase subunit B  43.42 
 
 
244 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  46.38 
 
 
167 aa  136  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.58 
 
 
191 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.26 
 
 
183 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  45.28 
 
 
195 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.76 
 
 
169 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.43 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03261  NADH dehydrogenase subunit B  43.42 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.67 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0231  NADH dehydrogenase subunit B  45.99 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0295  NADH dehydrogenase subunit B  43.42 
 
 
244 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1288  NADH dehydrogenase subunit B  43.45 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2249  NADH dehydrogenase subunit B  43.04 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0435349  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  44.83 
 
 
193 aa  135  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0846  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.68 
 
 
291 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000000927627  decreased coverage  0.0000000011698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  43.79 
 
 
195 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  42.03 
 
 
190 aa  135  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  46.62 
 
 
188 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3500  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
240 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.693948 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  44.83 
 
 
193 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
195 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
197 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>