More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3169 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  83.7 
 
 		 184 aa  327  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  83.7 
 
 		 184 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  80.98 
 
 		 184 aa  320  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  80.98 
 
 		 184 aa  318  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  80.98 
 
 		 184 aa  318  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  81.52 
 
 		 184 aa  300  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  73.91 
 
 		 184 aa  294  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  73.91 
 
 		 184 aa  293  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.63 
 
 		 183 aa  290  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.46 
 
 		 184 aa  289  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  74.16 
 
 		 185 aa  289  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  72.28 
 
 		 183 aa  289  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  74.16 
 
 		 183 aa  288  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  76.09 
 
 		 183 aa  283  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.85 
 
 		 181 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  71.91 
 
 		 183 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.58 
 
 		 183 aa  281  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  75 
 
 		 216 aa  280  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  79.14 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  69.4 
 
 		 183 aa  277  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  73.22 
 
 		 184 aa  274  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  74.69 
 
 		 199 aa  269  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  72.35 
 
 		 182 aa  268  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.25 
 
 		 226 aa  267  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  73.01 
 
 		 271 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  78 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  70.24 
 
 		 226 aa  259  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  70.24 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.71 
 
 		 180 aa  240  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  70.21 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.45 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  64.52 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  60.87 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  59.64 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  63.58 
 
 		 167 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  61.01 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  60 
 
 		 167 aa  213  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.76 
 
 		 202 aa  207  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  48.47 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 		 170 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 		 166 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 		 200 aa  197  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 		 170 aa  197  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  57.33 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  58.67 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.86 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 		 170 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  62.86 
 
 		 173 aa  194  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.33 
 
 		 169 aa  194  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1150  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.96 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  55.7 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.78 
 
 		 794 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 159 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.78 
 
 		 794 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 159 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  55.26 
 
 		 159 aa  192  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  50.56 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  57.14 
 
 		 158 aa  191  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  54.61 
 
 		 159 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  51.41 
 
 		 268 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.96 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  54.37 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  53.5 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.14 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 		 264 aa  187  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 		 171 aa  187  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.5 
 
 		 170 aa  187  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  50.93 
 
 		 167 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.67 
 
 		 230 aa  187  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.68 
 
 		 794 aa  187  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.42 
 
 		 169 aa  187  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  56.95 
 
 		 158 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  54.42 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.84 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  55.84 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  55.84 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  55.32 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  55.84 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  55.84 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  55.84 
 
 		 159 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  55.19 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  57.75 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  54.09 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>