More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0521 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  80.57 
 
 		 183 aa  306  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  79.43 
 
 		 185 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  76.63 
 
 		 184 aa  300  5.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  78.09 
 
 		 183 aa  300  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  76.63 
 
 		 184 aa  298  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.65 
 
 		 181 aa  297  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  75.54 
 
 		 184 aa  297  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  75.54 
 
 		 184 aa  297  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.22 
 
 		 183 aa  291  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  73.74 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  72.83 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  72.83 
 
 		 184 aa  289  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.39 
 
 		 226 aa  286  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.91 
 
 		 184 aa  285  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  73.37 
 
 		 184 aa  284  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  78.57 
 
 		 199 aa  284  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  78.53 
 
 		 182 aa  282  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  79.5 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  75 
 
 		 184 aa  279  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  73.6 
 
 		 264 aa  278  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  73.37 
 
 		 183 aa  277  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  72.47 
 
 		 271 aa  276  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.48 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  71.74 
 
 		 183 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  78.48 
 
 		 226 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  78.48 
 
 		 226 aa  271  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  69.95 
 
 		 184 aa  264  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.97 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  68.35 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  67.79 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  68.24 
 
 		 178 aa  226  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  58.99 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  66.44 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  62.2 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  58.75 
 
 		 213 aa  217  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 167 aa  214  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  60.9 
 
 		 167 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.23 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.22 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.8 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.63 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  52.05 
 
 		 170 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 		 173 aa  201  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  52.05 
 
 		 170 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.84 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 200 aa  199  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.26 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.33 
 
 		 200 aa  197  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 		 183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.33 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  52.94 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  57.89 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  58.78 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.63 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1528  NADH dehydrogenase subunit B  52.87 
 
 		 170 aa  187  9e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.152485  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  53.5 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.33 
 
 		 794 aa  185  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.9 
 
 		 158 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  52.63 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.33 
 
 		 794 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  52.9 
 
 		 158 aa  184  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  51.97 
 
 		 159 aa  184  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 		 158 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 		 160 aa  183  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  52.17 
 
 		 160 aa  183  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.444713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.9 
 
 		 159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  51.25 
 
 		 160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  53.55 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  52.26 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1444  NADH dehydrogenase subunit B  54.17 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0432732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  51.32 
 
 		 159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  51.32 
 
 		 159 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  52.03 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  52.98 
 
 		 268 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>