161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2816 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2816  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0335697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2544  alkylhydroperoxidase AhpD core  93.3 
 
 		 195 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.165226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.82 
 
 		 196 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  72.02 
 
 		 199 aa  298  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.31 
 
 		 196 aa  295  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  72.68 
 
 		 197 aa  295  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  68.37 
 
 		 196 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3579  uncharacterized peroxidase-related enzyme  72.19 
 
 		 197 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.95961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3941  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.66 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0161606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4506  uncharacterized peroxidase-related enzyme  66.49 
 
 		 398 aa  276  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2539  uncharacterized peroxidase  70.43 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5106  uncharacterized peroxidase-related enzyme  71.66 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5313  uncharacterized peroxidase-related enzyme  70.43 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.1 
 
 		 369 aa  271  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3885  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.62 
 
 		 369 aa  271  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0113459  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  70.43 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0419  uncharacterized peroxidase-related enzyme  65.61 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0531  uncharacterized peroxidase-related enzyme  63.83 
 
 		 386 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.482172  hitchhiker  0.0000452351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3853  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.02 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  45.03 
 
 		 372 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0666  uncharacterized peroxidase-related enzyme  46.07 
 
 		 191 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.240929  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0026  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.27 
 
 		 371 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3152  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.09 
 
 		 372 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.93611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.54 
 
 		 377 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4461  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.5 
 
 		 377 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7169  hypothetical protein  36.41 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4848  hypothetical protein  43.16 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.78 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1051  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.62 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2634  uncharacterized peroxidase-related enzyme  39.13 
 
 		 396 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05610  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  38.83 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429163  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4899  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.77 
 
 		 202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17780  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain  37.31 
 
 		 391 aa  111  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.162216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2744  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.14 
 
 		 472 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  33.11 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.88 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  35.07 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  37.5 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.07 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.07 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.76 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.72 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.58 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.82 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  32.84 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  29.22 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.47 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3017  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.19 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271489  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.19 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.29 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1869  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.73 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0138584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  32.09 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.09 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.48 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.6 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  31.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.53 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.86 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.85 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.6 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.49 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  28.48 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.4 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.1 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1633  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.91 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.34 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  27.81 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0194  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.14 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1887  hypothetical protein  28.73 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2585  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2630  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2624  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1779  hypothetical protein  28.73 
 
 		 426 aa  67.8  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.89 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.74 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.82 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.29 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  30.37 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2546  hypothetical protein  28.73 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.32 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.05 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  29.06 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  32.74 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.44 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.36 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4285  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  27.39 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4562  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.19 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.86 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8777  peroxidase family protein  35.71 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  24.86 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.61 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>