More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0952 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  80.95 
 
 		 264 aa  401  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  73.78 
 
 		 258 aa  359  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  68.89 
 
 		 258 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  68.89 
 
 		 259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  67.41 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  66.22 
 
 		 258 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  63.39 
 
 		 225 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  63.84 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  68 
 
 		 258 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  68 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  41.07 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  39.82 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  41.96 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  41.52 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  43.05 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  42.61 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  43.24 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.36 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  44.16 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  40.44 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  40.18 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  38.57 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  42.15 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  41.75 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  41.78 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  37.78 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  41.95 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  39.35 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  42.22 
 
 		 256 aa  157  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  38.05 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  38.05 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  38.05 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  38.05 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  37.78 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  36.53 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  39.38 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  37.95 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  44.66 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  38.33 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  36.89 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1568  putative TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.227212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  37.33 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  38.29 
 
 		 260 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2313  TatD-related deoxyribonuclease  43.14 
 
 		 282 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  37.95 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  38.53 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1042  TatD-related deoxyribonuclease  37.72 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  37.67 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  39.61 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  38.36 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1213  TatD family hydrolase  36.89 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  39.61 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  39.61 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  39.61 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2565  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0486072  normal  0.0819176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  37.89 
 
 		 270 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  43.89 
 
 		 244 aa  151  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  37.22 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3221  TatD-related deoxyribonuclease  42.18 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  37.05 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  37.67 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  37.5 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3552  TatD-related deoxyribonuclease  38.24 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158223  decreased coverage  0.000000675028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  36.45 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  36.77 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  42.16 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  31.84 
 
 		 258 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  35.81 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  38.2 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  36.32 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0239  TatD family deoxyribonuclease  35.09 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 293 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.27 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  39.01 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  40.39 
 
 		 284 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  37.68 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.08 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.98 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.98 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  40.83 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>