105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6234 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  266  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  96.48 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  71.22 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  63.31 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  62.14 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  61.15 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  67.86 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  66.67 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  61.31 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.96 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  57.86 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  65 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.68 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.97 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  61.31 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  59.71 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.56 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  61.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  61.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  61.15 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  58.82 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.34 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  64.06 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  67.97 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.86 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  59.71 
 
 		 145 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  46.27 
 
 		 138 aa  126  8.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.27 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  44.78 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  42.22 
 
 		 293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.75 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.51 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.26 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.61 
 
 		 287 aa  103  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  43.57 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  43.57 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  43.57 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.57 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  41.01 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  43.26 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.97 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.02 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  31.71 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.61 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.99 
 
 		 307 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  35.06 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.71 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  27.19 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04290  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 730 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0256394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  36.36 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.69 
 
 		 303 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  33.01 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  33.01 
 
 		 294 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  33.01 
 
 		 294 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  33.8 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  37.21 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  27.62 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  42.31 
 
 		 317 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  35.48 
 
 		 345 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  28.04 
 
 		 302 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02309  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  31.07 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  37.18 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  29.01 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0805  transporter DMT superfamily protein  42.67 
 
 		 298 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00148413  normal  0.0268128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  39.19 
 
 		 295 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  39.19 
 
 		 295 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  39.19 
 
 		 298 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  39.19 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  39.19 
 
 		 295 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>