223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1615 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  96.34 
 
 		 383 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  33.7 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  38.75 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.93 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 398 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 383 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  33.91 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  36.13 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  39.39 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.14 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  33.33 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  36.09 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 407 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2626  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.31 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.686935  hitchhiker  0.0081174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  35.59 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.33 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  34.37 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  35.69 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  29.53 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  32.76 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  30.45 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  29.53 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  29.53 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  29.53 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 439 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.08 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  29.27 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  35.34 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6269  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.280386  normal  0.421192 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3157  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  32.9 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  33.25 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.25 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  33.25 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 415 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>