More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5257 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  96.96 
 
 		 428 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  97.2 
 
 		 428 aa  861    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  99.3 
 
 		 478 aa  874    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  880    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  69.39 
 
 		 428 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  67.29 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  60.84 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  43.19 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  43.43 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  43.43 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  45.32 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 423 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 427 aa  322  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  45.98 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  42.93 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 440 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 427 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 430 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  35.64 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  33.82 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  33.25 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 434 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 431 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 428 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 425 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 425 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 433 aa  156  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.98 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.58 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.99 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.11 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.59 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  28.61 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 436 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.29 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.59 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.92 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.92 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.92 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 		 426 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.92 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>