More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78343 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  100 
 
 		 346 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  54.97 
 
 		 337 aa  344  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  57.68 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  51.91 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  51.03 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  54.55 
 
 		 336 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  50.88 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  45.91 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  46.51 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  45.35 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  46.65 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  46.65 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  46.65 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  53.93 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  44.9 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  44.67 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  45.19 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  44.8 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  44.77 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  45.8 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  44.77 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  44.67 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  44.67 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  45.06 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  44.67 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  45.71 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  44.38 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  44.67 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  50.92 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  44.61 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  45.06 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  45.06 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  44.06 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  44.48 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  43.9 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  44.61 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  44.19 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  43.9 
 
 		 311 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  43.9 
 
 		 311 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  44.19 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  43.02 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  44.48 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  43.02 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  43.02 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  44.19 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  43.02 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  44.19 
 
 		 311 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  43.53 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  42.9 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  44.96 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  44.44 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  31.82 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.17 
 
 		 316 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  35.32 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  34.39 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  31.38 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.8 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  29.68 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4584  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.45 
 
 		 320 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  34.62 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  34.62 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  34.03 
 
 		 312 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  36.56 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.04 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.28 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.19 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  34.44 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.62 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  30.04 
 
 		 317 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.46 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  34.19 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  31.22 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.7 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  33.76 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  34.19 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  30.83 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  36.13 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2802  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.93 
 
 		 311 aa  95.9  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  34.17 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.94 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  38.96 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  33.04 
 
 		 320 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  34.17 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  37.2 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  28.31 
 
 		 313 aa  95.1  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  33.47 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  36.59 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  34.39 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  37.2 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  28.84 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.19 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>