More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40132 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  671    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  59.4 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  54.97 
 
 		 346 aa  344  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  53.15 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  51.2 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  52.41 
 
 		 332 aa  309  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  52.23 
 
 		 336 aa  305  9.000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  48.22 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  48.49 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  46.11 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  47.34 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  47.01 
 
 		 319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  47.34 
 
 		 312 aa  268  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  46.75 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  46.75 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  45.86 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  46.13 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  46.45 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  45.86 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  46.15 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  45.86 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  46.15 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  46.27 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  46.87 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  46.27 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  45.99 
 
 		 311 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  46.27 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  45.97 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  45.67 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  44.78 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  45.83 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  45.83 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  45.83 
 
 		 311 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  45.54 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  43.98 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  44.35 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  45.67 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  44.78 
 
 		 311 aa  248  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  44.64 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  45.83 
 
 		 311 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  47.02 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  46.13 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  49.5 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  43.11 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.45 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  34.33 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  34.75 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0605  malate dehydrogenase  31.43 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  33.97 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  32.13 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  33.13 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.34 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  29.31 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  30.63 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4459  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.92 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  30.51 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.76 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.37 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.84 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  32.52 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  35.02 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.75 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.64 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  32.72 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  30.51 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  30.51 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.54 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.56 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  33.88 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  32.72 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  31.61 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  32.72 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  31.03 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  30.43 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.36 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  33.04 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  28.91 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  25.69 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  29.48 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.45 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  31.91 
 
 		 320 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  30.74 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  29 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.42 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>