More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_24671 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  100 
 
 		 335 aa  671    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  62.74 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  61.61 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  60.19 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  56.1 
 
 		 338 aa  351  8e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  56.83 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  56.55 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  55.27 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  55.91 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  54.95 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  54.95 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  54.95 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  54.31 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  55.29 
 
 		 332 aa  319  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  55.91 
 
 		 311 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  54.86 
 
 		 353 aa  318  6e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  56.23 
 
 		 312 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  53.99 
 
 		 311 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  55.45 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  53.99 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  54.95 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  55.45 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  55.45 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  55.45 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  54.95 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 311 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  55.13 
 
 		 312 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  55.77 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  57.05 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  54.63 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  315  9e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  315  9e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 311 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 311 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  54.17 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  54.81 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  53.35 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  54.49 
 
 		 312 aa  311  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  53.85 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  54.63 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  55.24 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  53.04 
 
 		 311 aa  309  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  53.53 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  53.21 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 311 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  48.49 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  51.6 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  49.04 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  51.68 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  45.35 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  43.65 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  36.56 
 
 		 318 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  29.9 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  33.6 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.98 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  31 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.32 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  31.17 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  31.17 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  30.7 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  33.56 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  31.48 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  31.48 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  34.48 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  33.33 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0697  malate dehydrogenase  33.2 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0864  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.07 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2971  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.03 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.184219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  30.79 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.78 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  31.33 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  32.11 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  28.96 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  31.14 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4496  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.44 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.794515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  30.87 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  31.97 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  31.69 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  32.76 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  30.25 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  30.25 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  31.28 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  30.25 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.02 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>