More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0956 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
315 aa  627  1e-179  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  55.13 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  53.09 
 
 
320 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  52.44 
 
 
321 aa  341  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  54.07 
 
 
313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  52.44 
 
 
321 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  52.73 
 
 
320 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  53.09 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  52.73 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  52.12 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.44 
 
 
320 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  51.92 
 
 
320 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  51.79 
 
 
320 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  52.56 
 
 
320 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  51.79 
 
 
320 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  52.56 
 
 
338 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  50.32 
 
 
322 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  51.45 
 
 
320 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  52.88 
 
 
320 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  53.42 
 
 
320 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  51.14 
 
 
320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  50.49 
 
 
320 aa  326  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  52.88 
 
 
320 aa  326  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  54.07 
 
 
313 aa  325  5e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  51.6 
 
 
320 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.92 
 
 
320 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  51.28 
 
 
322 aa  322  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.24 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  52.77 
 
 
320 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  52.77 
 
 
320 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  50.64 
 
 
322 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  50.64 
 
 
322 aa  318  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.24 
 
 
320 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.24 
 
 
320 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  50.64 
 
 
322 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  50.64 
 
 
322 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  48.72 
 
 
320 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.64 
 
 
320 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  51.28 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.6 
 
 
321 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.92 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  49.84 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.44 
 
 
311 aa  294  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  49.52 
 
 
312 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  46.45 
 
 
316 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  45.72 
 
 
309 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4584  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.44 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  45.19 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  45.81 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  45.81 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  48.24 
 
 
312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  45.81 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  46.95 
 
 
317 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  44.92 
 
 
308 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  45.02 
 
 
317 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  43.83 
 
 
313 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  43.79 
 
 
310 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  44.95 
 
 
314 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  45.34 
 
 
317 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  48.88 
 
 
312 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  48.88 
 
 
312 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  45.03 
 
 
309 aa  276  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  44.37 
 
 
318 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  44.69 
 
 
317 aa  275  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  42.72 
 
 
310 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  45.36 
 
 
309 aa  275  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  46.73 
 
 
312 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  44.37 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  43.38 
 
 
310 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  43.65 
 
 
308 aa  271  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  43.55 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  44.98 
 
 
312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  43.37 
 
 
312 aa  268  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  43.04 
 
 
312 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  44.01 
 
 
312 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  41.14 
 
 
316 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  43.69 
 
 
312 aa  265  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  41.83 
 
 
310 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  41.72 
 
 
310 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.93 
 
 
326 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.19 
 
 
312 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  44.04 
 
 
310 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  43.73 
 
 
312 aa  258  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2377  malate dehydrogenase, NAD-dependent  43.46 
 
 
307 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.379215  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  43.93 
 
 
324 aa  256  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  41.46 
 
 
319 aa  255  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  43.71 
 
 
310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  40.45 
 
 
311 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.16 
 
 
320 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  42.16 
 
 
320 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1689  Lactate/malate dehydrogenase  42.39 
 
 
310 aa  248  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>