More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0297 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0297  malate dehydrogenase  100 
 
 		 319 aa  634    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0609  malate dehydrogenase  72.9 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0952  malate dehydrogenase  72.9 
 
 		 311 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0373108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3685  malate dehydrogenase  72.9 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0867  malate dehydrogenase  73.87 
 
 		 311 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000793131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3509  malate dehydrogenase  72.9 
 
 		 311 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0303223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3809  malate dehydrogenase  72.58 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0770  malate dehydrogenase  71.61 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1002  malate dehydrogenase  72.9 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000312167  hitchhiker  0.0000277575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3219  malate dehydrogenase  71.61 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3627  malate dehydrogenase  72.58 
 
 		 311 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.454276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3339  malate dehydrogenase  72.58 
 
 		 311 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0614  malate dehydrogenase  72.58 
 
 		 311 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0850  malate dehydrogenase  73.23 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0826  malate dehydrogenase  71.29 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3173  malate dehydrogenase  71.94 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0439183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0672  malate dehydrogenase  71.94 
 
 		 311 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03096  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0470  malate dehydrogenase, NAD-dependent  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3719  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0322257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4553  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0724333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3540  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0470  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03047  hypothetical protein  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3425  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.672879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3671  malate dehydrogenase  70.51 
 
 		 312 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.306817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3532  malate dehydrogenase  71.15 
 
 		 312 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.45791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0469  malate dehydrogenase  70.1 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000123185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3657  malate dehydrogenase  70.29 
 
 		 312 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3719  malate dehydrogenase  69.97 
 
 		 312 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3622  malate dehydrogenase  69.55 
 
 		 312 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.817971  normal  0.609182 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3551  malate dehydrogenase  70.29 
 
 		 312 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3550  malate dehydrogenase  70.29 
 
 		 312 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3761  malate dehydrogenase  69.23 
 
 		 312 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.420142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3616  malate dehydrogenase  69.23 
 
 		 312 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0359  malate dehydrogenase  69.68 
 
 		 311 aa  434  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000905728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3971  malate dehydrogenase  69.23 
 
 		 312 aa  434  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3484  malate dehydrogenase  69.23 
 
 		 313 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000124556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00795  malate dehydrogenase  67.96 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2850  malate dehydrogenase  67.52 
 
 		 353 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.371941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0788  malate dehydrogenase  67.1 
 
 		 311 aa  422  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000050316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0553  malate dehydrogenase  67.1 
 
 		 312 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000757079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001676  malate dehydrogenase  67.31 
 
 		 311 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000765273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1055  malate dehydrogenase  69.77 
 
 		 311 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000618832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3365  malate dehydrogenase  65.38 
 
 		 312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000174685  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0539  malate dehydrogenase  66.67 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00736  malate dehydrogenase  67.41 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4514  malate dehydrogenase  63.67 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32875  predicted protein  54.02 
 
 		 370 aa  296  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12282  predicted protein  52.88 
 
 		 319 aa  292  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51297  predicted protein  51.88 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24671  predicted protein  49.36 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.880693  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03490  malate dehydrogenase, putative  48.56 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06717  malate dehydrogenase (Eurofung)  48.41 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66451  mitochondrial malate dehydrogenase  49.52 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390905  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06499  malate dehydrogenase, NAD-dependent (AFU_orthologue; AFUA_6G05210)  45.87 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0415235 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40132  NAD-dependent malate dehydrogenase  43.4 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.019207 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03100  L-malate dehydrogenase, putative  48.18 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.116944  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78343  malate dehydrogenase  45.53 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.25351  decreased coverage  0.000277635 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05031  conserved hypothetical protein: similar to cytplasmic malate dehydrogenase (Eurofung)  42.51 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.702277 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  30.62 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  34.6 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.88 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.88 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  31.93 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  31.51 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.96 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  34.13 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  33.44 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  34.8 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.47 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.51 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  28.38 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  33.78 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  32.58 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  35.65 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.58 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  32.54 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  30.67 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  32.88 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5970  malate dehydrogenase, NAD-dependent  35.14 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284223  normal  0.475687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  31.31 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  31.8 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  35.37 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  30.85 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  33.22 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  31.35 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  31.05 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  29.5 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  29.93 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  29.97 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  30.27 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  28.48 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  29.25 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  31.86 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.22 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  33.33 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  31.8 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>