More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1210 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  79.5 
 
 		 320 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  80.19 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  78.91 
 
 		 320 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  76.66 
 
 		 333 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  78.91 
 
 		 338 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  78.27 
 
 		 320 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  78.59 
 
 		 320 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  77.92 
 
 		 320 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  77.29 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  77.6 
 
 		 320 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  77.14 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  76.03 
 
 		 321 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  76.03 
 
 		 320 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  74.53 
 
 		 320 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  73.19 
 
 		 321 aa  488  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  76.34 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  75.16 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  75.16 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  71.92 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  75.4 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  72.52 
 
 		 320 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  75.4 
 
 		 320 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  71.61 
 
 		 322 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  72.56 
 
 		 320 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  71.7 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  74.44 
 
 		 320 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  74.45 
 
 		 321 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  74.45 
 
 		 320 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  72.87 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  72.87 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  71.61 
 
 		 322 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  71.07 
 
 		 322 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  72.24 
 
 		 322 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  70.48 
 
 		 320 aa  461  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  69.72 
 
 		 322 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  69.4 
 
 		 322 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  70.98 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  69.09 
 
 		 321 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  61.17 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  59.49 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  59.49 
 
 		 316 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  58.04 
 
 		 317 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  59.49 
 
 		 316 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  59.18 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  58.04 
 
 		 317 aa  384  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  58.04 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  57.86 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  58.96 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  58.33 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  57.73 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  56.41 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  55.21 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  61.02 
 
 		 312 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  54.52 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  56.31 
 
 		 309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4584  malate dehydrogenase, NAD-dependent  60.32 
 
 		 320 aa  361  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  52.87 
 
 		 314 aa  361  8e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  55.95 
 
 		 312 aa  360  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  53.99 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  53.67 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  61.34 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  61.34 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  54.98 
 
 		 312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  58.15 
 
 		 312 aa  351  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  53.7 
 
 		 312 aa  350  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  53.55 
 
 		 308 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  53.38 
 
 		 312 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  54.19 
 
 		 313 aa  345  5e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  51.12 
 
 		 318 aa  344  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.24 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  54.31 
 
 		 309 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  51.68 
 
 		 310 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  51.16 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  49.35 
 
 		 307 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  51.34 
 
 		 310 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  51.82 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  50.67 
 
 		 310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  48.85 
 
 		 313 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  53.02 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.68 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.68 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  51.01 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  46.86 
 
 		 310 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.01 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  50.99 
 
 		 312 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1140  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.23 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.208998  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.96 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50 
 
 		 312 aa  291  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  47.68 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>