More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1925 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1925  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
320 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.282591  normal  0.451174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1643  malate dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
320 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.329919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1587  malate dehydrogenase, NAD-dependent  96.25 
 
 
320 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.295644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1123  malate dehydrogenase, NAD-dependent  89.69 
 
 
320 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0919  malate dehydrogenase, NAD-dependent  89.69 
 
 
320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2161  malate dehydrogenase, NAD-dependent  89.06 
 
 
320 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0930  malate dehydrogenase  79.31 
 
 
320 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1856  malate dehydrogenase  79.31 
 
 
320 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1927  malate dehydrogenase  78.68 
 
 
320 aa  517  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0561  malate dehydrogenase  77.81 
 
 
320 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394685  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3604  malate dehydrogenase, NAD-dependent  82.5 
 
 
320 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  0.254256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4129  malate dehydrogenase  77.74 
 
 
320 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0968  malate dehydrogenase  76.25 
 
 
338 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2501  malate dehydrogenase, NAD-dependent  81.88 
 
 
321 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.448823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2628  malate dehydrogenase  76.25 
 
 
320 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2876  malate dehydrogenase  76.49 
 
 
320 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3395  malate dehydrogenase  77.12 
 
 
321 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0080  malate dehydrogenase  75 
 
 
320 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0187  malate dehydrogenase  77.12 
 
 
322 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0818  malate dehydrogenase  75.62 
 
 
320 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3517  malate dehydrogenase  74.38 
 
 
320 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1300  malate dehydrogenase  74.69 
 
 
320 aa  501  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1450  malate dehydrogenase, NAD-dependent  75.32 
 
 
333 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2829  malate dehydrogenase (NAD)  75.86 
 
 
320 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0022  malate dehydrogenase  73.67 
 
 
321 aa  496  1e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2944  malate dehydrogenase  76.8 
 
 
320 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.533999  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  73.12 
 
 
320 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0535  malate dehydrogenase  77.74 
 
 
322 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5004  malate dehydrogenase  74.29 
 
 
320 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0281  malate dehydrogenase  77.78 
 
 
322 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0194  malate dehydrogenase  76.49 
 
 
322 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0545  malate dehydrogenase  75.87 
 
 
322 aa  482  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.557349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3685  malate dehydrogenase  76.19 
 
 
320 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3974  malate dehydrogenase  76.19 
 
 
320 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342256  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2230  malate dehydrogenase  72.5 
 
 
320 aa  478  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0153  malate dehydrogenase  75.24 
 
 
321 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0419  malate dehydrogenase  74.29 
 
 
322 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0392  malate dehydrogenase  76.83 
 
 
322 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.208989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1210  malate dehydrogenase  75.16 
 
 
318 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  63.78 
 
 
316 aa  440  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1589  malate dehydrogenase  64.56 
 
 
316 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0268739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1466  malate dehydrogenase  63.41 
 
 
317 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0862702  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1649  malate dehydrogenase  65.82 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2226  malate dehydrogenase  65.82 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2327  malate dehydrogenase  62.78 
 
 
317 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1722  malate dehydrogenase  65.51 
 
 
316 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1325  malate dehydrogenase  62.78 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000410815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2193  malate dehydrogenase  61.01 
 
 
318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000748395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1625  malate dehydrogenase  61.32 
 
 
321 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000635356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2900  malate dehydrogenase  62.46 
 
 
317 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048511  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1360  malate dehydrogenase  60.25 
 
 
317 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756192  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1626  malate dehydrogenase  67.73 
 
 
312 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4584  malate dehydrogenase, NAD-dependent  62.5 
 
 
320 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2185  malate dehydrogenase  66.01 
 
 
312 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  55.66 
 
 
313 aa  380  1e-104  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2234  malate dehydrogenase  66.77 
 
 
312 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2322  malate dehydrogenase  66.77 
 
 
312 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0749738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1037  malate dehydrogenase  55.56 
 
 
318 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.217027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0283  malate dehydrogenase  54.95 
 
 
309 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0253  malate dehydrogenase  54.63 
 
 
309 aa  371  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.041825  normal  0.0135962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  54.72 
 
 
308 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  55.31 
 
 
311 aa  362  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  55.34 
 
 
313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0783  malate dehydrogenase  54.49 
 
 
312 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3276  malate dehydrogenase  54.17 
 
 
312 aa  355  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  53.23 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2677  malate dehydrogenase  53.33 
 
 
312 aa  352  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4206  malate dehydrogenase  52.06 
 
 
314 aa  351  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  53.07 
 
 
308 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4723  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4702  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4486  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4321  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0536  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4718  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4837  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4707  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4333  malate dehydrogenase  52.24 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4422  malate dehydrogenase  51.59 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0956  malate dehydrogenase, NAD-dependent  52.24 
 
 
315 aa  333  3e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2290  malate dehydrogenase  51.44 
 
 
309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.974079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1510  malate dehydrogenase  49.2 
 
 
310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0354026  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1900  malate dehydrogenase  51.1 
 
 
310 aa  328  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1029  malate dehydrogenase  50.32 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  50.48 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  48.9 
 
 
310 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  48.37 
 
 
307 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  45.43 
 
 
310 aa  309  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2178  malate dehydrogenase, NAD-dependent  49.34 
 
 
326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00838959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1603  malate dehydrogenase  49.21 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2347  malate dehydrogenase, NAD-dependent  54.66 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1713  malate dehydrogenase  48.9 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.905202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0539  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.3 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0522  malate dehydrogenase, NAD-dependent  47.3 
 
 
320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1088  malate dehydrogenase, NAD-dependent  45.02 
 
 
316 aa  298  9e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00100592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3020  malate dehydrogenase (NAD)  48.68 
 
 
312 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1656  malate dehydrogenase, NAD-dependent  48.05 
 
 
312 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  46.79 
 
 
324 aa  292  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  44.09 
 
 
313 aa  291  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  47.23 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>